Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rd3lB2RV38 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms