Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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