Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prr16A3KMN5 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Prr16A3KMN5 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Prr16A3KMN5 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Prr16A3KMN5 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Prr16A3KMN5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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