Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms