Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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