Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabreA2AMW3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms