Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ambra1A2AH22 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms