Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprfA2A8L5 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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PtprfA2A8L5 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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