Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb4A2A863 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms