Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3550W4VSN7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms