Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Vstm4T1NXB5 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms