Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Mrpl40Q9Z2Q5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Mrpl40Q9Z2Q5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Mrpl40Q9Z2Q5 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Mrpl40Q9Z2Q5 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Mrpl40Q9Z2Q5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Mrpl40Q9Z2Q5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Mrpl40Q9Z2Q5 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Mrpl40Q9Z2Q5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Mrpl40Q9Z2Q5 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Mrpl40Q9Z2Q5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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