Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms