Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trpc2Q9R244 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Trpc2Q9R244 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Trpc2Q9R244 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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