Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
AmfrQ9R049 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms