Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn8Q9QZ49 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms