Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYR7

Acot3, Acyl-coenzyme A thioesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acot3Q9QYR7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acot3Q9QYR7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acot3Q9QYR7 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms