Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdcQ9QW08 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdcQ9QW08 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.1 ms