Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cabp1Q9JLK7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
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