Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms