Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ybx3Q9JKB3 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ybx3Q9JKB3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms