Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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