Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQJ0

Tpcn1, Two pore calcium channel protein 1, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpcn1Q9EQJ0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tpcn1Q9EQJ0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tpcn1Q9EQJ0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tpcn1Q9EQJ0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tpcn1Q9EQJ0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tpcn1Q9EQJ0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tpcn1Q9EQJ0 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpcn1Q9EQJ0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tpcn1Q9EQJ0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpcn1Q9EQJ0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpcn1Q9EQJ0 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpcn1Q9EQJ0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpcn1Q9EQJ0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpcn1Q9EQJ0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Tpcn1Q9EQJ0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpcn1Q9EQJ0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpcn1Q9EQJ0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Tpcn1Q9EQJ0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Tpcn1Q9EQJ0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpcn1Q9EQJ0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpcn1Q9EQJ0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Tpcn1Q9EQJ0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Tpcn1Q9EQJ0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpcn1Q9EQJ0 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Tpcn1Q9EQJ0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpcn1Q9EQJ0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpcn1Q9EQJ0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpcn1Q9EQJ0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpcn1Q9EQJ0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Tpcn1Q9EQJ0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpcn1Q9EQJ0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpcn1Q9EQJ0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Tpcn1Q9EQJ0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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