Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tlr1Q9EPQ1 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms