Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clstn1Q9EPL2 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms