Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Hmg20aQ9DC33 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hmg20aQ9DC33 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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