Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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