Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgf29Q9DA08 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgf29Q9DA08 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgf29Q9DA08 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgf29Q9DA08 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgf29Q9DA08 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgf29Q9DA08 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgf29Q9DA08 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgf29Q9DA08 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgf29Q9DA08 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgf29Q9DA08 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgf29Q9DA08 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgf29Q9DA08 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgf29Q9DA08 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgf29Q9DA08 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgf29Q9DA08 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgf29Q9DA08 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgf29Q9DA08 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgf29Q9DA08 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgf29Q9DA08 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgf29Q9DA08 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgf29Q9DA08 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgf29Q9DA08 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgf29Q9DA08 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgf29Q9DA08 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgf29Q9DA08 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgf29Q9DA08 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgf29Q9DA08 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgf29Q9DA08 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgf29Q9DA08 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgf29Q9DA08 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgf29Q9DA08 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgf29Q9DA08 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgf29Q9DA08 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgf29Q9DA08 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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