Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Subh2bvQ9D9Z7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Subh2bvQ9D9Z7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Subh2bvQ9D9Z7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Subh2bvQ9D9Z7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Subh2bvQ9D9Z7 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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