Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Atg7Q9D906 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Atg7Q9D906 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Atg7Q9D906 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Atg7Q9D906 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Atg7Q9D906 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Atg7Q9D906 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Atg7Q9D906 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg7Q9D906 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Atg7Q9D906 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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