Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc9bQ9D6E4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms