Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Ccdc7Q9D541 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Ccdc7Q9D541 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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