Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms2Q9D4B1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgms2Q9D4B1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgms2Q9D4B1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgms2Q9D4B1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgms2Q9D4B1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgms2Q9D4B1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgms2Q9D4B1 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgms2Q9D4B1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgms2Q9D4B1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgms2Q9D4B1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgms2Q9D4B1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgms2Q9D4B1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgms2Q9D4B1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgms2Q9D4B1 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgms2Q9D4B1 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgms2Q9D4B1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgms2Q9D4B1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgms2Q9D4B1 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgms2Q9D4B1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgms2Q9D4B1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgms2Q9D4B1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgms2Q9D4B1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgms2Q9D4B1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Sgms2Q9D4B1 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms