Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

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Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Snx29Q9D3S3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Snx29Q9D3S3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Snx29Q9D3S3 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Snx29Q9D3S3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Snx29Q9D3S3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Snx29Q9D3S3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Snx29Q9D3S3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Snx29Q9D3S3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Snx29Q9D3S3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Snx29Q9D3S3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Snx29Q9D3S3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Snx29Q9D3S3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Snx29Q9D3S3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Snx29Q9D3S3 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx29Q9D3S3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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