Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2cQ9D1C1 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ube2cQ9D1C1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ube2cQ9D1C1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ube2cQ9D1C1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ube2cQ9D1C1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ube2cQ9D1C1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ube2cQ9D1C1 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ube2cQ9D1C1 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ube2cQ9D1C1 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ube2cQ9D1C1 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ube2cQ9D1C1 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ube2cQ9D1C1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2cQ9D1C1 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2cQ9D1C1 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2cQ9D1C1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2cQ9D1C1 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2cQ9D1C1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2cQ9D1C1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2cQ9D1C1 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2cQ9D1C1 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2cQ9D1C1 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2cQ9D1C1 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms