Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Mms19Q9D071 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Mms19Q9D071 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mms19Q9D071 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mms19Q9D071 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mms19Q9D071 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Mms19Q9D071 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Mms19Q9D071 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Mms19Q9D071 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Mms19Q9D071 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Mms19Q9D071 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mms19Q9D071 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Mms19Q9D071 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms