Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYC3

Tmem39a, Transmembrane protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39aQ9CYC3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem39aQ9CYC3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39aQ9CYC3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39aQ9CYC3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39aQ9CYC3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39aQ9CYC3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39aQ9CYC3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39aQ9CYC3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39aQ9CYC3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39aQ9CYC3 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39aQ9CYC3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39aQ9CYC3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39aQ9CYC3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39aQ9CYC3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39aQ9CYC3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39aQ9CYC3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39aQ9CYC3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39aQ9CYC3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39aQ9CYC3 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39aQ9CYC3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39aQ9CYC3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39aQ9CYC3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39aQ9CYC3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39aQ9CYC3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39aQ9CYC3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39aQ9CYC3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39aQ9CYC3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39aQ9CYC3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39aQ9CYC3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39aQ9CYC3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39aQ9CYC3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39aQ9CYC3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39aQ9CYC3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39aQ9CYC3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39aQ9CYC3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39aQ9CYC3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem39aQ9CYC3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms