Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT6

Kdm8, JmjC domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm8Q9CXT6 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm8Q9CXT6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm8Q9CXT6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm8Q9CXT6 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm8Q9CXT6 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm8Q9CXT6 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm8Q9CXT6 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm8Q9CXT6 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm8Q9CXT6 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm8Q9CXT6 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm8Q9CXT6 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm8Q9CXT6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm8Q9CXT6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm8Q9CXT6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm8Q9CXT6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm8Q9CXT6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm8Q9CXT6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm8Q9CXT6 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm8Q9CXT6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm8Q9CXT6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm8Q9CXT6 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm8Q9CXT6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kdm8Q9CXT6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kdm8Q9CXT6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kdm8Q9CXT6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kdm8Q9CXT6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kdm8Q9CXT6 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Kdm8Q9CXT6 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kdm8Q9CXT6 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kdm8Q9CXT6 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kdm8Q9CXT6 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kdm8Q9CXT6 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kdm8Q9CXT6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms