Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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RpainQ9CWY9 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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RpainQ9CWY9 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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RpainQ9CWY9 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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