Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sft2d3Q9CSV6 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Sft2d3Q9CSV6 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Sft2d3Q9CSV6 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Sft2d3Q9CSV6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Sft2d3Q9CSV6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Sft2d3Q9CSV6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Sft2d3Q9CSV6 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Sft2d3Q9CSV6 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sft2d3Q9CSV6 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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