Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9CRC3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9CRC3 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q9CRC3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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