Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rwdd1Q9CQK7 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms