Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdm1Q9CQK3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms