Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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