Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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PtprtQ99M80 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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PtprtQ99M80 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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PtprtQ99M80 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprtQ99M80 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
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