Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gdpd3Q99LY2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms