Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim11aQ99J19 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms