Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clip1Q922J3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms