Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD3

Tm4sf4, Transmembrane 4 L6 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf4Q91XD3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm4sf4Q91XD3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm4sf4Q91XD3 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms