Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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